Creative solutions
我们提供覆盖10x Genomics、Smart-seq、Microwell-seq等平台的单细胞数据分析服务，涵盖从标准流程到高级机制挖掘，已支持多个高分文章与临床转化研究。
服务内容可根据项目方向、组织类型与研究目标进行模块化定制，适用于肿瘤、免疫、发育、感染、微生态等多个研究场景。
What we offer
以下展示部分常见或高阶单细胞分析模块，更多内容欢迎定制化咨询。
亚群识别与marker注释
高精度细胞亚群分群（支持SCTransform/CCA整合），结合文献marker、自动注释（ScType/SingleR）与差异表达挖掘，精准定义组织中细胞图谱。
细胞通讯与调控网络分析
基于CellChat/NicheNet/iTALK等方法推断细胞间配体-受体通信关系，构建多细胞系统中的上下游调控网络，适用于免疫-肿瘤、干细胞-微环境等研究。
细胞轨迹与状态转换分析
构建细胞发育路径（Monocle/Slingshot/PAGA），识别关键转折点与状态标志物，结合pseudotime曲线展示发育动态或应激响应过程。
单细胞瘤内菌群分析
基于细菌mRNA序列残留的UMI特征进行细菌reads提取与分类，联合宿主细胞图谱实现肿瘤微生态-细胞类型的联合图谱，适用于肠癌、肺癌等组织微生物研究。
单细胞耐药机制分析
基于细胞亚群聚类、耐药相关通路打分、轨迹分析与细胞通讯推断，挖掘耐药相关细胞及调控机制。可结合 Scissor 工具将 bulk 表型（如药物响应、存活率）映射到单细胞，精准定位与表型高度相关的细胞群体，适用于肿瘤耐药、免疫逃逸等研究。
单细胞免疫治疗相关分析
结合TCR/BCR测序、免疫细胞亚群注释、免疫耗竭打分、细胞通讯与免疫活性通路富集，挖掘免疫治疗应答相关细胞特征。可进一步结合临床表型使用 Scissor 识别应答/非应答相关细胞群体，适用于免疫检查点治疗（ICI）、CAR-T等课题研究。
单细胞+机器学习分型预测
提取表达特征或整合bulk数据，使用机器学习方法（lasso/随机森林/SVM）构建风险模型或细胞状态预测模型，支持分型与个体化机制建模。
单细胞多组学联合分析
整合单细胞转录组、染色质可及性（ATAC）及空转（spatial transcriptomics）等数据，构建空间-表达-调控三维图谱，挖掘关键细胞类型的转录调控网络与空间定位特征，适用于肿瘤微环境、器官发育与免疫异质性研究。
