5 月
27
2026
你的10x数据里，reads 1可能藏着被忽视的宝藏。这篇Genome Biology论文发现，first-strand reads能以近单核苷酸分辨率检测polyadenylation site，比现有方法精度提升12倍。无需额外测序，只需换个分析视角。
这篇Genome Biology发表的APA检测方法中，scTail首次实现了利用first-strand reads的精确PAS检测。研究团队整合多个公共3′ scRNA-seq数据集，开发了scTail算法框架：利用first-strand reads实现近单核苷酸分辨率PAS检测（中位距离-11bp vs second-strand的-132bp），嵌入CNN序列分类器过滤假阳性，结合BRIE2进行差异APA分析。在肠道分化、食管鳞状细胞癌和小鼠前肢发育中揭示了alternative PAS usage的关键调控作用，发现PAS表达谱可提供基因水平表达之外的补充信息。值得注意的是，该方法需要reads 1保留cDNA序列的10x数据，目前支持人和小鼠两种物种的CNN分类器。您有相关疾病的APA机制研究需求可以联系小编哦！
5 月
15
2026
本研究发现心肌梗死（MI）后由三个核心节点构成的双向心脑神经免疫环路：节点 1（迷走神经 TRPV1 感觉神经元） 感知心肌损伤后激活，节点 2（下丘脑室旁核 AT1aR 神经元） 接收信号并整合，通过节点 3（颈上神经节 SCG） 释放促炎因子 IL-1β 增强交感神经支配，加剧心肌损伤；而靶向任一节点（TRPV1 神经元消融、AT1aR 神经元抑制、SCG 中 IL-1β 阻断）均可显著缩小梗死面积、改善心脏功能、减少炎症反应，为 MI 治疗提供了全新的神经免疫靶向策略。
5 月
15
2026
新助研生物技术团队深耕生信领域14年+，今天这篇肝癌（HCC）的一区大作深度结合了单细胞、空间转录组以及前沿深度学习算法（虚拟敲除）等前沿技术。公共数据+自测数据的多组学深度解析能发到8分+的Top期刊，不仅工作量扎实，其思路更是堪称“王炸”组合。快来复现吧
本研究的几大技术优势
Biosalt新助研
1）选题妙：系统剖析推动肝细胞癌（HCC）进展的细胞生态系统，涵盖了正常肝脏、原发肿瘤、门静脉癌栓（PVTT）、转移性淋巴结（MLN）全过程。这种选题优势仍旧很大，对数据要求较高。
2）技术组合前沿：单细胞+空间转录组，该研究首次构建了HCC全过程的分子+空间双重维度细胞图谱。
3）虚拟敲除：虚拟敲除的算法有很多，该研究利用预训练的Geneformer模型，针对HCC进展中3类关键的细胞状态（免疫抑制巨噬细胞重极化、恶性肝细胞正常化、异常内皮细胞正常化）开展虚拟敲除筛选，高效锁定了跨细胞类型的收敛性候选基因，并结合DepMap数据库完成基因依赖性验证，大幅提升了治疗靶点筛选的效率和精准性。
5 月
15
2026
胸腺上皮肿瘤（TET）是前纵隔最常见的非淋巴瘤性肿瘤，作为罕见恶性肿瘤其发病机制与免疫微环境调控关联密切，且不同病理亚型的临床行为和患者预后差异显著。目前临床对 TETs 的分型多依赖病理形态学，缺乏基于免疫景观的精准分型策略，且肿瘤免疫微环境的异质性对 TETs 进展、预后的调控机制尚未明确。本次研究基于免疫景观构建 TETs 分子分型，首次系统揭示不同亚型的微环境特征与预后差异，为 TETs 的精准诊疗和预后评估提供全新的免疫分子依据。
5 月
15
2026
在肿瘤免疫微环境中，CD4+ T 细胞的作用常常被其“兄弟” CD8+ T 细胞的光芒所掩盖。然而，随着研究的深入，CD4+ T 细胞在抗肿瘤和促肿瘤反应中的双重角色正越来越受到重视。今天为大家分享的这篇文章，正是巧妙地结合了转录组学范围的孟德尔随机化（MR）与单细胞转录组测序（scRNA-seq）技术，在CD4+ T 细胞激活的动态过程中，为结直肠癌（CRC）找到了全新的免疫治疗靶点。
5 月
15
2026
本研究通过高精度的多模态转录组学技术，不仅绘制了详尽的海马衰老分子图谱，还提出了一个重要的观点：年龄相关的神经发生衰退是由神经干细胞内在的深度静息化/激活障碍，以及外源性T细胞介导的神经炎症共同驱动的。
特别是发现CD8+ T细胞在衰老海马中的浸润及其对神经发生的抑制作用，为干预衰老相关的认知衰退提供了新的潜在靶点——即通过调节神经炎症或增强血脑屏障功能来保护神经发生微环境。该研究产生的大规模数据集也将成为未来神经科学和衰老研究领域的重要资源。
